Profilexpert propose des prestations d’analyse de génomique  (Génome et transcriptome) par QRTPCR, PCR, NGS à partir de cellules uniques isolées (single cell genomics) par  la technologie de DEParray (Ménarini Silicon Biosystems)

Applications :

Analyse du transcriptome et du génome sur cellules rares (scRNA-seq, ATACseq), étude de CTC (cellules tumorales circulantes), cellules souches, phylogénie cellulaire

Natures des échantillons traités :

Cellules fraîches isolées à partir de culture de cellules, cellules issues de tissu dissocié, cellules fixées, CTC fixées issues du CellSearch

Services :

• Aide au plan expérimental (choix du nombre de cellules à analyser, profondeur de séquençage, full length RNA ou 3’end etc…)
• Séparation des cellules, marquage, imagerie des cellules, sélection des cellules d’intérêt sur critères morphologiques ou de marqueurs membranaires ou intracellulaires
• Lyse des cellules  et amplification des acides nucléiques
• Analyse par PCR (Biomark), Microarray et Séquençage NGS (HiSeq et Nextseq Illumina)

 

DEParray (Menarini Silicon biosystem) : http://www.siliconbiosystems.com/deparray-nxt