ProfileXpert

Analyse du méthylome par beadarray

image47Profilexpert propose des prestations d’analyse du méthylome par analyse en microarrays de régions méthylées par analyse d’ADN bisulfité par la technologie beadchip 850K ou EPIC Illumina.

Applications :

Profiling du méthylome sur ilots CpG, methylation de promoteurs, de séquences répétées

Natures des échantillons :

ADN extraits de cellules, tissus, biopsies, fluides (sang…), ADN extrait bisulfité, ADN issu de tissu FFPE, ADN immunoprécipité..


Services :

  • Extraction de l’ADN, Quantification et contrôle qualité,
  • Traitement bisulfite, Contrôle rendement de conversion
  • Restoration de l’ADN (FFPE)
  • Hybridation sur puces Beadarray Illumina : human Beachip 850 K (EPIC) après traitement bisulfite
  • Espèces analysables : humain

 

Nous avons besoin :
De 250 ng à 1 µg d’ADN génomique à la concentration minimale de 100 ng/ul eau. Pour des quantités plus faibles d’ADN totaux, nous contacter.

Livrables :

Un rapport comprenant : les contrôles qualité, les contrôle d’efficacité du traitement bisulfite, les ratio de cytosines méthylés et non méthylés, les DMP (positions différentiellement méthylées),  les régions différentiellement méthylées (DMR), les données brutes (raw data, fichiers idat) non normalisées et normalisées.

Support technologiques :

Beadchip 850K (Illumina) : https://emea.illumina.com/techniques/microarrays/methylation-arrays.html

 

Publications associées : voir  méthylome