ProfileXpert

Analyse du Régulome par NGS (ChIP-Seq)

image51Profilexpert propose des prestations d’analyse des interactions protéines/ADN et protéines/ARN  par Séquençage  de régions enrichies par immunoprécipitations de chromatine (ChIP-seq) ou d’ARN (RIP-seq)

Applications : Caractérisation de sites de fixation de facteurs de transcription, d’ARN cibles de facteurs traductionnels…

Natures des échantillons : chromatine ou ARN immunoprécipités

Services :

  • Quantification et qualification des produits immunoprécipités
  • Calcul d’enrichissement par PCR
  • Séquençage des régions immunoprécipitées.
  • Alignement des séquences sur génome de référence
  • Localisation des régions cibles, caractérisations des ARN immunoprécipités

Nous avons besoin :
De 10 ng d’ADN immunoprécipité à la concentration minimale de 10ng/µL.
Pour des quantités plus faibles d’ADN totaux, nous contacter.

Livrables :
Un rapport incluant : les contrôles qualité des ADN/ARN immunoprécipités, les données brutes avant et après démultiplexage, les coordonnées des régions immunoprécipitées ou l’identifiant des ARN. 

Activités associées : Comparaison des résultats avec des données extraites de la littérature (banques de données)

Publications associées : voir régulome