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Analyse de l’Epigénome

image42L’épigénétique est l’ensemble des mécanismes moléculaires ayant lieu au niveau du génome et de la régulation de l’expression des gènes qui peuvent être influencés par l’environnement et l’histoire individuelle ainsi qu’être potentiellement transmissibles d’une génération à l’autre, sans altération des séquences nucléotidiques (ADN), et avec un caractère réversible.

Les nouvelles technologies de génomique offrent l’opportunité de pouvoir analyser l’épigénome à différents niveaux :

  • La méthylation du génome
  • L’acétylation des histones
  • Le MiRNome

Par les technologies de :

  • Séquençage NGS à l’aide du HiSeq 2500, NextSeq 500 et MiSeq (Illumina)
  • Microarrays à l’aide des plateformes Affymetrix et Agilent
  • qRTPCR en temps réel à l’aide des technologies :
    • Taqman low density array ouTLDA (Applied Biosystem)
    • Lightcycler 480 ou Lightcycler Caroussel (Roche)