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Analyse du Régulome

image50Le régulome rassemblent l’ensemble des interactions intervenant dans la cellule avec notamment celles impliquant les interactions protéines/ADN ou protéines/ARN à différents niveaux de résolution conduisant à la régulation de l’activité du génome.

L’étude du régulome consiste à analyser au niveau génome complet ou du transcriptome, les interactions entre des facteurs de transcription et l’ADN ou des facteurs de régulation de la traduction, de rechercher les sites de fixation et les interactions entre facteurs eux-mêmes. Par les techniques de :

  • Séquençage NGS de régions d’ADN génomique immunoprécipitées  à l’aide d’un anticorps spécifiques dirigés contre un facteur de transcription  (ChIP-Seq) ou d’ARN (RIP-seq)
  • Microarray (puces promoteur ou Tiling) (ChIP-chip) ou (RIP-chip)
  • PCR pour la validation des données (ChIP-pcr) ou (RIP-pcr)