ProfileXpert

Extraction et purification des acides nucléiques

image18ProfileXpert propose des prestations d’extraction et de purification d’acides nucléiques à partir de tissus congelés ou de tissus FFPE.

Applications : 

  • Purification des ARN
  • Purification d’ARN < 200nt
  • Purification d’ADN génomique

Nature des échantillons traités :
Cellules en culture, tissus congelés ou FFPE,  échantillons issus de captures laser, ou de tri cellulaire, biopsies, fluides (sang,  lavages broncho-alvéolaires, liquide céphalo-rachidien surnageants viraux)

image17Services : 

  • Extraction et Purification des ARN et/ou ADN.
  • Quantification et Contrôles qualités :
    • les contrôles qualités des ADN portent sur la pureté (ratio absorbance 260/230 et 260/280) et l’intégrité qui est évaluée sur gel.
    • Les contrôles qualités des ARN portent sur la pureté (ratio des absorbance 260/230 et 260/280), et l’intégrité qui est évaluée sur BioAnalyseur.
  • La quantification des ARN et ADN est évaluée par spectrophotométrie en utilisant le nanodrop ou par fluorométrie (Qubit). 

Equipement

  • FastPrep, Qiacube  (Qiagen)
  • Nanodrop, Qubit
  • Bioanalyser 2100  (Agilent), Experion (BioRad)

Livrables :

  • Les rapports 260/280
  • Les rapport 260/230
  • Les valeurs des RIN (RNA integrity number)
  • Les profils Bioanalyseur des ARN totaux
  • Les profiles électrophorétiques des ADN
  • La concentration des ARN et ADN et la quantité totale

Activités associées :

  • Enrichissement d’acides nucléiques
  • Amplification d’acides nucléiques
  • Analyse du génome, transcriptome, régulome/épigénome par microarray, NGS ou PCR