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Analyse de Génotypage

image33Les nouvelles technologies de génomique offrent l’opportunité de pouvoir analyser la structure du génome (Génotypage de génome eucaryote et procaryote) au niveau génome complet par reséquençage NGS ou micro- et beadarrays, pour la recherche d’altérations au niveau génome entier  (translocations, CNV, polymorphismes) ou à un niveau plus ciblé (région ou gènes), pour l’interrogation spécifique d’un ou plusieurs marqueurs candidats.

Les technologies proposées sont :

Séquençage NGS :
Profilexpert propose d’analyser les altérations du génome connues ou inconnues (CNV, polymorphismes, translocations , LOH, gene fusion etc..) par :

  • Séquençage de génome complet (eucaryote et procaryotes)
  • Séquençage de génome après réduction de complexité (exome, chromosome spécifique)
  • Séquençage de régions ciblées (amplicons, amplicon 16S)

Microarrays et beadarrays :
Profilexpert propose d’analyser les altérations du génome (CNV, polymorphismes) par :

  • La technologie beadarrays  (Illumina)

PCR :
Profilexpert propose d’analyser les altérations spécifiques du génome (CNV, polymorphismes, translocations etc..) par :

  • Les technologies Taqman sur Applied 7900 HT fast PCR system
  • Les technologies Lightcycler 480 et Lightcycler capillaire
  • La technologies de HRM (High Resolution Melting) (Corbett)