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Analyse du Métagénome par Séquençage de l’ARN 16S (Méta16S-seq)

Profilexpert offre un service complet d’analyse de l’ARN 16S (régions variables V3/V4, V4/V5) par séquençage NGS (Méta16S-seq) à l’aide des technologies HiSeq 2500, NextSeq 500 et MiSeqimage54

 

Applications : Analyse de la diversité microbienne dans un milieu complexe, phylogénie bactérienne

Nature des échantillons traités : organismes, tissus et  liquides biologiques, sol, air, eau, préparations biotechnologiques

Services :

  • Aide au plan expérimental
  • Extraction de l’ADN, Quantification et contrôle qualité
  • Dessin des couples d’oligonucléotide
  • Amplification PCR des régions variables
  • Quantification et contrôle qualité des amplicons,
  • Séquençage sur Hiseq 2500, NextSeq 500 ou MiSeq
  • Caractérisation des génomes composant le milieu étudié

Nous avons besoin :

De 10 µg d’ADN génomique à la concentration minimale de 50ng/uL. Pour des quantités plus faibles d’ADN totaux, nous contacter.

Livrables :

Un rapport incluant : Les contrôles qualité des ADN, contrôle qualité des amplicons, les données brutes non normalisées et normalisées après démultiplexage

Activités associées : Proportion des différents génomes dans le milieu étudié, comparaison par rapport à des données extraites de la littérature,

Publications associées : voir métagénome