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Analyse du Méthylome

image43La méthylation de l’ ADN est un processus épigénétique dans lequel certaines bases nucléotidiques (cytosine)  peuvent être modifiées par l’addition d’un groupement méthyle.

La méthylation de l’ADN agit comme un « patron » qui conditionne l’expression des gènes dans chaque cellule. Ce patron épigénétique intervient dans la mise en place du programme génétique au cours du développement embryonnaire. Chez les mammifères, le processus de méthylation de l’ADN est de plus influencé ensuite par des facteurs environnementaux : sociaux, nutritionnels et toxicologiques.

La méthylation de l’ADN est reconnue comme étant un processus réversible.

La méthylation du génome peut être analysée à différents niveaux de résolution :

  • Au niveau génome complet par séquençage NGS d’ADN génomique bisulfité (BSeq)
  • Au niveau de régions ciblées (Reduced Representation Bisulfite Sequencing ou RRBS, MeDIP-seq, Methyl-seq)

par les technologies de :

  • Séquençage NGS sur HisSeq 2500, Nextseq500 et MiSeq
  • Microarray (puces promoteur ou Tiling) ou beadarrays (beadarrays  infinium 450K)
  • PCR pour la validation des données (MSP, HRM)