Profilexpert offre un service complet d’ analyse en métagénomique par amplification PCR  de régions spécifiques (régions variables ARNr 16S, gènes spécifiques..) pour le profilage de panels d’organismes présélectionnés (bactéries, virus, champignons)  par les technologies Applied 7900HT fast PCR system (Applied Biosystem) ou LC480 (Roche).

Applications : Analyse de la diversité microbienne dans un milieu complexe, phylogénie bactérienne

Nature des échantillons traités : Organismes,tissus et  liquides biologiques, sol, air, eau, préparations biotechnologiques

Services :

• Aide au plan expérimental
• Extraction de l’ADN, Quantification et contrôle qualité
• Dessin des panels custom, utilisation de panel commerciaux (oral disease, sepsis, intestinal, food testing…)
• Amplification PCR des régions variables
• Quantification et contrôle qualité des amplicons,
• Caractérisation des génomes composant le milieu étudié

Nous avons besoin :

De 10 ug d’ADN génomique à la concentration minimale de 50ng/uL. Pour des quantités plus faibles d’ADN totaux, nous contacter.

Livrables :

Un rapport incluant : Les contrôles qualité des ADN, contrôle qualité des amplicons, les données brutes non normalisées et normalisées après démultiplexage

Supports technologiques : 

Oral microbiome : http://www.qiagen.com/~/media/genetable/ba/oraldisease

Publications associées : voir métagénome.