ProfileXpert

Analyse du Régulome par microarray (ChIP-chip)

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Profilexpert propose des prestations d’analyse des interactions protéines/ADN et protéines/ARN  par analyse microarray  de régions enrichies par immunoprécipitation de chromatine (ChIP-chip) ou d’ARN (RIP-chip)

Applications : Caractérisation de sites de fixation de facteurs de transcription, d’ARN cibles de facteurs traductionnels…

Natures des échantillons : chromatine ou ARN immunoprécipités

Services :

  • Quantification et qualification des produits immunoprécipités
  • Calcul d’enrichissement par PCR
  • Marquage des régions immunoprécipitées
  • Hybridation sur puces : Genechip promoteur, microarray tiling (Affymetrix) ou Agilent : Puces promoteur
  • Localisation des régions cibles, caractérisation des ARN immunoprécipités

Nous avons besoin :
De 10 ng d’ADN immunoprécipité à la concentration minimale de 50ng/uL.
Pour des quantités plus faibles d’ADN totaux, nous contacter.

Livrables :
Un rapport incluant : les contrôles qualité des ADN/ARN immunoprécipités, les données brutes avant et après démultiplexage, les coordonnées des régions immunoprécipitées ou l’identifiant des ARN. 

Activités associées : Comparaison des résultats avec des données extraites de la littérature (banques de données)

Publications associées : voir régulome